家蚕质型多角体病毒(苏州株)全基因组序列特征
我们从感染家蚕体内分离到一株质型多角体病毒并且命名为BmCPV-Suzhou，通过对该病毒纯化， 核酸提取与片段分离，经过RT-PCR和克隆测序，获得BmCPV1-Suzhou全基因组10条dsRNA（S1-S10） 的完整序列并上传至GenBank。序列分析表明该病毒基因组序列全长24,758 bp，每个片段具有一个完整的 开放阅读框。BLAST检索显示该病毒基因组各片段与已公开的部分BmCPV片段序列具有高度的同源性， 达88％以上，而编码蛋白的氨基酸序列同源性达91％以上。RNA末端比较发现每个RNA片段的5’和3’ 末端分别存在保守序列: 5’AGUAA………A/GxC/GGUUAGCC3’，并且在不同属的病毒之间也存在着特定的保守 序列。通过对S2编码的RDRP进行的生物信息学分析发现RDRP的催化中心位于497－727氨基酸残基间； 在S3编码的VP3蛋白序列中位于355-357和1220 -1222间有两个细胞黏附序列RGD。系统进化分析表明 BmCPV-Suzhou与BmCPV（日本H株和中国广州株）以及LdCPV1、DpCPV1聚为一类，并且与中国广州 株的亲缘关系最近，说明该病毒属于1型多角体病毒，可能和BmCPV-China起源于同一病毒。
家蚕 质型多角体病毒 基因组片段1-10 系统进化分析 RDRP
孟祥坤 曹广力 张晓荣 朱越雄 薛仁宇 贡成良
苏州大学医学部,江苏苏州 215123 苏州大学医学部,江苏苏州215123
国内会议
杭州
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21-33
1900-01-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）