山羊卵巢组织繁殖力相关差异表达基因片段的生物信息学分析
为考察山羊多羔性的遗传基础，用同一品种不同繁殖力山羊发情期卵巢组织差异表达PCR方法筛查到4条基凶差异显示片段作为山羊繁殖力性状候选基因，对这些候选基凶进行同源性和转录因子结合位点分析，发现4个差异片段中两条为新发现的表达片段。1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05同源性为81％，但功能未知。另1条差异片段的序列与牛PCNP的mRNA序列的同源性为94％，并据此对山羊PCNP基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学的相关软件和方法，对山羊PCNP蛋白的理化性质、二级结构、信号肽、核定位序列、磷酸化位点、跨膜区域以及蛋白质功能域等进行了预测，PCNP蛋白是一种定位于细胞核中的亲水蛋白，二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主，局部为延伸链和β转角：预测出与PCNP蛋白相互作用的5种蛋白，另外还发现了3个LCR(low complexity region)区域。
山羊 繁殖力 差异表达基因 生物信息学 蛋白质功能域
冯安学 钱丽丽 贾青 邢增喜
河北农业大学动物科技学院,保定 071001 河北农业大学动物科技学院,保定 071001 国家北方山区农业工程技术研究中心,保定 071001
国内会议
青海
中文
69-77
2011-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）