鸡主要组织相容性复合体基因B-G区域生物信息学分析
根据鸡主要组织相容性复合体(Major HistocompatibilityComplex,MHC)基因B—G区域外显子2的序列设计引物,采用直接测序的方法对该区域(207bp)进行序列测定,并对所获得核苷酸序列进行生物信息学分析。结果显示:该片段中碱基T、C、A、G的平均含量分别为22.0%、19.8%、24.8%、33.4%.C+G含量为53.2%,T+A含量为46.8%,C+G含量高于T+A含量。同时检测到27个核苷酸变异位点,导致14个氨基酸位点的变异。16条序列进行单倍型构建获得16种单倍型,单倍型多样度达到了高的多样水平。由试验结果表明鸡MHC—B—G基因外显子2的序列表现出了高度的多态性,并且其序列的多态性更多地表现在氨基酸水平上。
序列分析 鸡 复合体基因 B-G区域 生物信息学
余春林 蒋小松 杜华锐 徐亚欧 李小成 杨朝武 李晴云 李雯 张增荣
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2010-12-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)