近红外光谱法测定D16S539基因座的三个基因型
利用近红外光谱(NIRS)结合支持向量机(SVM)模式识别原理建立了短串联重复序列(STR)的分型方法。以D16S539基因座的9—9、9-11和11-11三种不同基因型为例，研究了包含该多态性位点的DNA片段的PCR扩增条什和NIRS检测条件，建立了标准化扩增条件和检测条件，以此条件获得了基因分型的标准物及其标准NIRS。以标准光谱为识别变量，建立该3类基因型的SVM判别模型，有效地克服了光谱共线性，并对少样本数表现出良好的稳定性，模型预测率100％、回归平方相关系数1.00、回归均方差为0。该方法不需任何检测前处理，而只需一步PCR扩增和NIRS检测即可实现STR分型，具有简单、快速、低成本等优点。
近红外光谱法 短串联重复序列 基因型测定 D16S539基因座
任丽 高玉振 汪维鹏 俞小卫 谢洪平
苏州大学医学部药学院，苏州，215123 苏州大学医学部法医学教研室，苏州，215123
国内会议
长沙
中文
268-273
2008-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）