犬细小病毒VP2基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

本研究以犬细小病毒(Canine parvovirus，CPV)阳性病犬血清中的CPV基因组DNA为模板，成功克隆出CPV-VP2基因，并对其进行生物学分析。测序结果表明，CPV-VP2完整的开放阅读框大小为1755 bp，共编码585个氨基酸残基。CPV-VP2基因与浣熊(M24005)的VP2基因同源性最高，水貂(FJ712219)和猫(M10824)的居中，与猪、奶牛、牛、鼠、鹅、鸡、人和松鼠的VP2丛因同源性较低：CPV-VP2蛋白质中无信号肽;大多数氨基酸偏好以T、A结尾的密码子：CPV-VP2蛋白可能存在7个糖基化位点，其丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别存在8、10、7个磷酸化位点，可能存存76个抗原表位。预测CPV-VP2蛋白为亲水性蛋白，无跨膜结构。预测到CPV-VP2蛋白的二级结构的α-螺旋区域占9．93％、β-折叠区域占24．49％、无规则卷曲区域占65．58％，三级结构存在多个螺旋和折叠区域，主要以无规则卷曲为主。三研究为CPV-VP2在原核或真核中的高效表达提供参考，并为制备CPV胶体金快速诊断试纸条和基因工程疫苗提供有益借鉴。

关键词： 犬细小病毒 VP2基因 克隆 生物信息学分析

作者: 叶新慧 申魁魁 郑喜邦

作者单位: 广西大学动物科技学院，南宁 530004

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会小动物医学分会第六次学术研讨会暨中国畜牧兽医学会兽医外科学分会第十八次学术研讨会

会议地点: 乌鲁木齐

会议语种:中文

页码: 58-61

在线出版日期: 2011-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）