基于HCV 6Kb扩增子的动态准种优势株的确定及包膜2基因正选择位点分析
背景和目的:丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染已成为全球性公共卫生问题,据估计全球约有2.1亿HCV感染者,其中85%发展成为慢性丙型肝炎.现有的抗HCV治疗方案十分有限且迄今尚无有效的疫苗问世。 HCV有效的免疫逃逸策略是HCV持续感染及疫苗研究困难的关键问题,但免疫逃逸的机制尚不清楚。研究表明,病毒适应环境的高度可变性的发生机制而非宿主免疫防御功能的缺陷或损伤,可能在病毒免疫逃逸中起更重要的作用.HCV具有明显的异质性,以一群不同但密切相关的变异株即准种(quasispecies,QS)存在于感染者体内.研究表明准种具有两个显著特性.其一是准种群体内变异株的分布是不均匀的,总以一种变异株为优势株即主要变异株(dominant variants);其二是是准种的优势变异株处于动态变化中,研究显示同一个体在不同的时间点准种的主要变异株是不同的,主要变异株的迁移可能反映了宿主的免疫压力及病毒的强大适应性。 由此可见,动态变化的HCV准种优势株蕴藏着病毒免疫逃逸的相关信息。对动态变化的HCV准种优势株长片段序列分析,以获得序列的变异特征及进化规律,是探索HCV免疫逃逸分子基础的新途径,而建立基于HCV长序列的、准确的、动态变化的准种优势株的鉴定方法是准种优势株相关研究的重要前提。
丙型肝炎病毒 动态准种优势株 包膜2基因 正选择位点
朱研 毛青 兰林 胡亚君 谭朝霞 张长江 王宇明 王小红
第三军医大学西南医院全军感染病研究所 重庆 400038
国内会议
重庆
中文
97-98
2010-09-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)