基于SIFT和PolyPhen验证错义SNP与生产性能的关联分析结果

摘要：

生物信息学工具SIFT和PolyPhen通过分析目的蛋白序列的保守性以及突变氨基酸的生化特性来预测氨基酸的替换对蛋白质功能造成的影响。从而可以对对错义突变产生的影响进行初步的预测，同时可用于验证关联分析所得到结果的可靠性。本研究随机选择的10个基因的12个错义突变中，SIFT和PolyPhen对其中10个突变的预测保持一致，同时与表型性状的关联分析结果保持一致。对另外两个突变预测纬论虽然相反，但关联分析数据与PolyPhen的结论保持一致。

关键词： 生物信息学 生产性能 蛋白序列 氨基酸 关联分析

作者: 滑留帅 李明勋 孙晓梅 张良志 陈宏

作者单位: 西北农林科技大学动物科技学院陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌 712100

会议类型: 国内会议

会议名称: 第十二次全国畜禽遗传标记研讨会

会议地点: 南京

会议语种:中文

页码: 176

在线出版日期: 2010-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）