中华鳖体表和体内菌群多样性分析
采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。从两个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树。在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13和10种RFLP谱型,分别挑选了70和60个克隆子进行测序。 结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为”5和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌(Bacteroidetes)和变形菌(Proteobacteria),并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌。
中华鳖 16S rDNA RFLP 细菌多样性 RFLP谱型 拟杆菌 变形菌
胡广洲 李登峰 苏秀榕 李太武 贺静静
应用海洋生物技术教育部重点实验室 宁波大学生命科学与生物工程学院 浙江宁波 315211
国内会议
宁波
中文
39-49
2009-11-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)