四带笛鲷线粒体基因组序列结构及进化
采用Long-PCR扩增线粒体全基因组方法得到了四带笛鲷线粒体基因组全序列,序列的分析结果表明,四带鲷线粒体基因组序列全长16514 bp,共有13个编码蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个D-loop区。在编码蛋白质基因中,除COI是以GTG作为起始密码子外,其它均是以ATG起始,ND1、COII、ND3以TAG作为终止密码子,而ND4、Cyt b则以不完全的T为终止密码子,其余8个蛋白质基因的终止密码子均为TAA。四带笛鲷线粒体基因组各基因长度、位置与典型的脊椎动物相似,其编码蛋白质基因和rRNA基因与其它硬骨鱼类具有很高的同源性。基于14种笛鲷线粒体区段COI、COII和Cyt b基因的全序列合并成的一个组合数据集构建系统进化树,显示四带笛鲷与孟加拉笛鲷笛鲷的亲缘关系最近。
四带笛鲷 线粒体基因组 系统进化 亲缘关系 编码蛋白质基因
谭围 王中铎 郭昱嵩 刘楚吾 刘丽
广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025
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2010-11-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)