PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷菌多样性探索中的应用
采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷古菌通用引物扩增16S rRNA基因序列,进行DGGE分析。将DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序,得到9条序列,其中3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性也高达99%。1条与甲烷短杆菌的同源性达98%,1条序列与广古菌门(Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98%。另外,有4条是和古菌存在序列相似性的未培养细菌,分别属于拟杆菌(Bacteroidetes),厚壁菌(Firmicutes),变形菌门(Proteobacteria.),几个细菌门类之间无太大同源性。
水牛瘤胃 产甲烷古菌 通用引物 基因序列
刘园园 王士长
广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530005
国内会议
哈尔滨
中文
180-186
2010-08-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)