珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化
本研究以江西宜丰种源毛红椿为材料,成功提取其基因组DNA。利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片断,并构建了富含微卫星的基因组文库。从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序,其中50个单克隆成功测序,含有微卫星的单克隆有18个,并根据测序结果设计并合成SSR引物18对。利用所合成的引物优化SSR反应体系,对影响SSR反应的各个因子进行了探讨。确定了模板DNA浓度最适浓度为30ng;dNTP的最适浓度为0.3mmol·L-1;0.3μmol·L-1是引物在反应体系中的最合适浓度。建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系,为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持。
毛红椿 珍稀濒危树种 微卫星DNA分离 链亲和素磁珠 SSR反应体系 遗传变异
刘军 孙宗修 陈益泰 何贵平 吴天林
中国林科院亚热带林业研究所,富阳 311400 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室,浙江 杭州 310006
国内会议
北京
中文
48-54
2006-10-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)