会议专题

甜杨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因的电子克隆及其功能预测

以甜杨的无菌苗为材料,4 ℃低温处理24h,提取总RNA,采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法首次从杨树中分离到一个新的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因,其cDNA长1697bp,可编码510个氨基酸,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与其它植物G6PDH存在着较高的同源性,说明所获得的cDNA是甜杨G6PDH基因(PsG6PDH,AY445917)。同时,运用PCR扩增技术获得了甜杨G6PDH基因组序列,测序结果表明,基因组DNA长度为5040bp,含有15个外显子和14个内含子。Southern杂交结果表明,G6PDH基因在甜杨的基因组中可能是单拷贝或者低拷贝。通过网络服务器平台进行PsG6DH的功能预测,结果显示PsG6PDH为G6PDH的成员之一,含有NADP结合区和G6P结合区两个保守功能域,具有多个磷酸化位点和跨膜区域,但不含有信号肽,表明PsG6DH可能作为膜受体而起作用。另外,C6PDH的电子表达谱分析结果发现,G6PDH几乎可在植物中整株表达,在多种组织和不同发育过程均表达,并涉及各种逆境胁迫应答反应,这也在一定程度上说明了G6PDH在植物生长反育中的重要地位。

甜杨 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因 电子克隆 cDNA序列 功能预测 逆境胁迫

林元震 张志毅 林善枝 张谦 王鑫

北京林业大学林木花卉遗传教育部重点实验室,北京 100083 华南农业大学林学院森林培育系,广州 510642 北京林业大学林木花卉遗传教育部重点实验室,北京 100083

国内会议

2006年全国博士生学术论坛——林业及生态建设领域相关学科

北京

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114-122

2006-10-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)