P-QuantWiz：一种基于质谱的并行非标记定量软件

摘要：

本文设计并实现了基于质谱的非标记定量软件QuantWiz,通过改变肽段定量的顺序,提高了定量软件的时间局部性和质谱数据缓存的命中次数。分析了QuantWiz的多种数据并行策略,设计并实现了按保留时间划分的并行定量软件P-QuantWiz。通过实验验证P-QuantWiz具有良好的并行效率,当进程数为32时,并行效率为63％。

关键词： 非标记定量 色谱峰 质谱数据 数据并行策略

作者: 胡泽林 张云泉 王靖 张先轶

作者单位: 中国科学院软件研究所并行计算实验室,北京,100190;中国科学院计算机科学国家重点实验室,北京,100190;中国科学院研究生院,北京,100049 中国科学院软件研究所并行计算实验室,北京,100190;中国科学院计算机科学国家重点实验室,北京,100190

会议类型: 国内会议

会议名称: 2009年全国理论计算机科学学术年会

会议地点: 哈尔滨

会议语种:中文

页码: 124-127

在线出版日期: 2009-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）