西藏小型猪细胞色素b基因序列和氨基酸序列的比较研究
目的:对西藏小型猪Cyt b基因序列和氨基酸序列进行分析,研究其遗传分化及其与国内地方猪包括巴马小型猪、贵州香猪和五指山猪的亲缘关系。 方法:提取西藏小型猪和巴马小型猪、贵州香猪、五指山猪的全基因组DNA,设计引物扩增Cyt b基因,测序后进行碱基序列和氨基酸序列比对,建立亲缘关系树,分析西藏小型猪的进化地位。 结果:西藏小型猪Cyt b基因序列有9个变异位点,核苷酸多样性为7.89％。Cyt b基因序列与欧洲猪相比西藏小型猪共有16个主要突变位点,其中有两个特殊碱基位点：420位点T→C转换和883位点的G→A转换,几乎各占50％。氨基酸序列分析表明,西藏小型猪与欧洲猪有三个位点氨基酸存在着差异,其中在295位点,大部分A型西藏小型猪与欧洲猪同为缬氨酸(V),而B型和少部分A型为异亮氨酸(I)。巴马小型猪、五指山猪和贵州香猪的氨基酸序列在295位点也为异亮氨酸(I)。 结论:巴马小型猪、贵州香猪、五指山猪与西藏小型猪有很近的亲缘关系。同时证实西藏小型猪群体内存在严重分化,西藏小型猪的一部分(A型)可能是中国家猪的祖先。
西藏小型猪 细胞色素B 基因序列 氨基酸序列 核苷酸多样性 亲缘关系
李洪涛 肖东 顾为望 吴清洪 袁进 王万山 张嘉宁
广州医学院第一附属医院,广州 510120 南方医科大学实验动物中心,广州 510515
国内会议
广州·东莞
中文
71-77
2010-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）