不同代次广西巴马小型猪内源性反转录病毒3”UTR克隆及结构和调控元件分析
本研究利用RACE技术成功扩增了广西巴马小型猪近交系连续4代次及封闭群的猪内源性反转录病毒(PERV)3”UTR,共获得了8条序列(GenBank登录号分别为：GQ475493、GQ475494、GQ475495、GQ475496、GQ475497、GQ475498、GQ475499、GQ475500),分为638 bp和749 bp两种不同的类型,都属于PERV-A亚型。以PERV-3”UTR构建遗传进化树,PERV-A,B,C分群清晰,3”UTR可作为PERV亚型区分的另一基田序列。对调控元件定位分析,推测具有749bp类型3”UTR的PERV病毒转录水平更高。在所获得序列的209～227 bp位置,发现了”CTTGAAACTT”10个碱基的1.9个重复。模拟RNA二级结构,广西巴马小型猪PERV-3”UTR两种类型无论从空间构型、自由能,还是茎环数量都存在明显的不同。这些结果为全面评价广西巴马小型猪来源的PERV病原安全性提供了参考。
猪内源性反转录病毒 广西巴马小型猪 RACE技术 遗传进化树
欧阳康 邓世杰 吴健敏 陈凤莲 张启模 郭亚芬
广西大学 动物科学技术学院,广西南宁 530005;广西壮族自治区兽医研究所 广西南宁 530001 广西壮族自治区兽医研究所 广西南宁 530001 广西大学 动物科学技术学院,广西南宁 530005
国内会议
广州·东莞
中文
388-394
2010-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）