会议专题

生物信息数据格式和数据抽提技术在PALPP中的应用

由中国科学院计算机网络信息中心、中国科学院植物研究所、中国科学院深圳仙湖植物园“三方两地”共同合作研究建设的陆地植物发育系统系统发育平台(PALPP)意在为科研人员提供数据和分析并举的工作平台,承担数据汇集和面向实际科研工作应用的双重作用。PALPP的应用数据涉及到核酸(DNA、RNA)、蛋白等的相关数据。在数据的整合以及各处理模块输入输出处理中,涉及多种生物信息学数据格式的应用和转换。本文针对陆地植物发育系统系统发育平台(PALPP)涉及的生物信息数据格式和其抽提技术进行研究总结,比较了国际生物信息学数据的主要存取式(GenBank、EMBL和SwissProt、FAST和NBRF、Intelligenetics格式、PIR格式等)和典型生物信息学处理工具的应用格式特点,提出在生物信息学术的抽提方法并进行应用示例。

生物信息数据格式 数据抽提 植物发育系统 系统发育平台

孟珍 胡良霖 黎建辉

中国科学院计算机网络信息中心科学数据中心,北京 100190

国内会议

第七届(2009)两岸三院信息技术与应用交流研讨会

丽江

中文

278-288

2009-09-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)