奶牛能量负平衡的基因集富集分析
奶牛繁殖力低的最常见原因之一,是能量供给不能满足它的需求或是能量处于负平衡状态(NEB)。长时间营养不良或者急性限饲,容易导致能量负平衡的发生。在泌乳早期,大多数奶牛由于不能摄入足够的能量而总是处于能量负平稳状态。目前研究集中在NEB对首次排卵的影响、对繁殖性能的改变、高蛋白日粮对繁殖的影响以及减少NEB改善繁殖性能等方面,但对于由NEB引起的牛基因表达的变化,仅见个别基因的研究。应用Affymetrix芯片进行NEB影响奶牛基因表达变化的研究已有报道,原作者进行了差异表达基因筛选,并对筛选的基因进行了通路分析。但差异表达基因的筛选,通常是得到一个差异表达的基因列表,只有那些差异表达显著的基因才受到关注,然而,在基因组转录水平的表达谱数据中,差异表达显著的基因只占很少的部分,大部分的基因对于不同类型的样本只表现出细微的表达变化。基因集富集分析检测基因集合而不是单个基因的表达变化,因此可以包含这些细微的表达变化,得到更为理想的结果。
奶牛 能量负平衡 基因芯片 富集分析 基因筛选
赵洪波 王起山 潘玉春
上海交通大学农业与生物学院,上海 200240
国内会议
陕西杨凌
中文
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2009-10-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)