重亚硫酸盐测序确定多胸椎蒙古羊hoxc8 exon-1 CpG岛甲基化位置与密度

摘要：

蒙古羊中多脊椎个体的胸椎和腰椎变异具有基因组印记(Genomic Imprinting)遗传特征，CpG岛中胞嘧啶的甲基化是印记所必需的。亚硫酸盐基因组测序(Bisulfate Sequencing) PCR专一地检测甲基化胞嘧啶，可以直接确定基因组DNA甲基化位点。因为亚硫酸氢盐处理后链不再互补，因此可以扩增并单独测序,亚硫酸氢盐处理的DNA PCR扩增产物可以直接测序检测甲基化平均水平，或克隆测序确定甲基化发生的位置。胞嗜咤残基与亚硫酸氢钠的反应导致选择性转化为尿嘧啶。只有非碱基配对胞嘧啶可以被亚硫酸氢钠有效的修饰，例如单链DNA。在特定条件下，反应具有高度选择性，非甲基化胞嘧啶残基完全反应，而5-甲基胞嘧啶则完全不转化。

关键词： 重亚硫酸盐测序 蒙古羊 遗传特征 基因组印记 甲基化位置

作者: 张立岭 陈琦 赵静 马月辉

作者单位: 内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特 010018 海南大学农学院，海口 570228 内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特 010018 中国农科院畜牧所，北京 100193

会议类型: 国内会议

会议名称: 第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

会议地点: 陕西杨凌

会议语种:中文

页码: 366

在线出版日期: 2009-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）