正交设计法优化印度南瓜SRAP反应体系
利用L43正交设计对影响南瓜SRAP反应体系的MgCl2浓度、dNTPs浓度、Taq酶含量、引物浓度、模板DNA浓度5个因素进行了筛选,快速得到稳定性和重复性好的南瓜SRAP扩增体系。另外对复性温度、PCR循环次数等影响南瓜SRAP扩增结果的重要因素进行了优化。最终优化的南瓜SRAP反应体系为25μL反应液中:10×buffer2.5μL,0.2mmol/L dNTPs,引物0.2μmol/L,1.5mmol/L MgCl2,DNA模板6ng/μL,Taq酶1.5U。本研究最终确立的PCR反应程序为:94℃预变性5 min,然后按94℃变性40 s,35℃退火40 s,72℃延伸90s,进行5个循环,94℃变性40 s,50℃退火40 s,72℃延伸90 s,进行32个循环,最后72℃延伸5min。在此条件下得到的SRAP标记可为印度南瓜遗传多样性、分子标记及辅助育种等研究提供稳定有效的手段。
南瓜 SRAP扩增 反应体系 正交设计 遗传多样性 分子标记
刘泽发 孙小武 罗伏青 严钦平
湖南省瓜类研究所,湖南邵阳 422001 湖南农业大学园艺园林学院,湖南长沙,410128 湖南省瓜类研究所,湖南邵阳 422001
国内会议
中国园艺学会南瓜分会2009年学术研讨会、西南地区南瓜产业化发展论坛、第三届会员代表大会
成都
中文
108-114
2009-05-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)