ASPCR检测微量HIV-1 K103N耐药突变方法的建立
目的:建立检测微量HIV-1 K103N耐药突变的等位基因特异扩增实时定量PCR(ASPCR)方法,用于微量K103N耐药突变的检测和分析。 方法:首先建立检测K103N耐药突变的ASPCR方法,然后对方法进行验证,最后采用ASPCR方法检测对照样本。构建含K103N突变的质粒作为标准品,然后设计特异性引物用以区分野生型和突变型模板,采用SYBR green法进行实时定量PCR,并绘制标准曲线。分别采用特异性和非特异性引物扩增模板,根据二者Ct(Cycle threshold)值结合相应的标准曲线判断是否存在K103N突变及突变比例。对ASPCR检测K103N突变位点的特异性、敏感性、准确性、重复性等进行验证。 结果:特异性和非特异性引物扩增等量野生型模板的Ct值之差(△Ct)可达13.56;当突变比例小于0.1%时仍具有良好的准确性;批内变异系数小于0.7%,批间变异系数小于1.6%;检测灵敏度可达0.01%。检测阴性对照样本的△Ct显著高于临界值,阳性对照样本检测结果均为阳性。 结论:ASPCR是一种快速、灵敏、准确的检测HIV-1微量耐药突变的方法,可为临床抗病毒治疗提供理论指导。
人类免疫缺陷病毒 免疫学检验 基因突变 耐药突变
郭东星 李韩平 李林 庄道民 王铮 鲍作义 刘思扬 刘永健 李敬云
军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京,100071
国内会议
贵阳
中文
142-146
2009-10-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)