北京地区急性散发性戊型肝炎中戊型肝炎病毒基因型及亚型分布
为了解北京地区急性散发性戊型肝炎患者感染的戊型肝炎病毒(HEV)基因型和亚型分布，本文采用实时荧光PCR的方法检测93例急性散发性戊型肝炎患者粪便标本，并对阳性粪便标本应用RT-PCR方法扩增HEV RNA开放读码框架2(ORF2)部分序列，进行克隆测序，利用生物信息学软件进行基因型和亚型分析。结果显示，93例急性戊型肝炎患者粪便标本经实时荧光PCR方法检测52份阳性(55.91％)。RT-PCR获得的41个克隆核苷酸序列同源性为83.3％～100％，与Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型HEV参考序列的同源性分别为77％～80.5％，78.6％～81.2％，76.7％～81％，83.3％～93.7％，41例均属于基因Ⅳ型。进化树分析提示41例可能属于3个基因亚型，6例为Ⅳa亚型，34例属Ⅳb亚型，另外1例(ya30)属于Ⅳ型，但单独形成一个亚型分支，可能为一个新的亚型。提示北京地区的急性散发性戊型肝炎中HEV属于Ⅳ型，但可能有不同的基因亚型。
戊型肝炎 病毒感染 免疫学检验 基因型 亚型分布
殷继明 赵晨燕 李卓 严艳 樊金萍 郝娃 马红霞 牛京勤 王佑春
首都医科大学附属北京佑安医院 北京市卫生局肝炎研究所,北京,100069 中国药品生物制品检定所,北京,100050
国内会议
贵阳
中文
198-202
2009-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）