基因组范围内ETS转录因子家族的识别与进化分析

摘要：

ETS蛋白是一个调节许多生物学过程的转录因子家族。对其进行了全基因组的分析,探讨了此基因家族的分类。从10种动物中,共识别了207个ETS基因并编码321个转录因子。在321个ETS转录因子中,有155个只包含了ETS结构域,约50%除了ETS结构域以外,还含有ETS PEA3N或SAM PNT域,其余的含有第二个ETS结构域或第二ETS_PEA3_N域或其他域(AT hook或DNA pol B)。通过利用ETS结构域内的氨基酸序列构建了NJ进化树,结果表明,此基因家族可分为两个不同的群体,第一组包含一个线虫基因的ETS和18个脊椎动物ETS基因：第二组中包含剩余的ETS转录因子,并可进一步分为11个子类。针对人、牛和鸡的ETS转录因子上的DNA结合域以外的氨基酸序列的模体分析以及外显子内含子结构模式的分析,发现这些结果进一步支持了系统发育树的分类结果。在每个物种的基因组中都发现了大量的ETS重复基因,约占69%。

关键词： ETS转录因子 全基因组 系统发育分析 氨基酸序列 ETS结构域

作者: 王志鹏 张勤

作者单位: 农业生物技术国家重点实验室,农业部动物遗传育种重点实验室,中国农业大学动物科学与技术学院,100093

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会信息技术分会2009年学术研讨会

会议地点: 哈尔滨

会议语种:中文

页码: 150-155

在线出版日期: 2009-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）