鸭病毒性肠炎病毒dUTPase基因密码子偏爱性特征分析

摘要：

本研究分析比较了新发现的鸭病毒性肠炎病毒（Duck Enteritis Virus DEV) dUTPase基因（登录号DQ486149）和32 种参考疱疹病毒dUTPase 基因序列的密码子使用偏爱性。结果表明DEV dUTPase 基因编码蛋白长为477个氨基酸链，其中包括五个以3-1-2-4-5为排列顺序的保守基序。CAI，ENC，GC3S 值表明疱疹病毒dUTPase同义密码子的使用呈偏爱性，与基因的宿主进化相关。DEV dUTPase基因密码子使用模式具有同源进化保守性，相似于禽类α疱疹病毒。不同生物物种的疱疹病毒dUTPase 基因密码子使用偏爱性各异，但不存在种属特异性。61种密码子使用在预测的多肽，第3位密码子强烈偏向于A和T。DEV dUTPase基因与大肠杆菌、酵母及人3种密码子使用频率差值较大的大肠杆菌有19个，酵母有16个，人有15个。方差分析显示DEV dUTPase基因密码子与酵母差异极显著(r=0.536，P<0.01)。DEV dUTPase基因的密码子使用偏爱性程度与基因表达水平有高度相关性，为基因分类地位的确定和功能研究提供有用数据。

关键词： 鸭病毒性肠炎病毒 dUTPase基因 密码子偏爱性 基因表达 同源进化

作者: 招丽婵 程安春 汪铭书 袁桂萍 蔡铭升

作者单位: 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心, 雅安, 625014 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心, 雅安, 625014 动物疫病与人类健康四川省重点实验室, 雅安, 625014 四川大学分析测试中心, 成都, 610064 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心, 雅安, 625014 动物疫病与人类健康四川省重点实验室, 雅安, 625014 四川大学分析测试中心, 成都, 610064

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会动物传染病学分会教学专业委员会第六届第12次学术研讨会

会议地点: 新疆石河子

会议语种:中文

页码: 203

在线出版日期: 2008-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）