新型鸭肝炎病毒GD株基因组序列分析

本研究对1999年从我国广东地区分离到的一株与1型鸭肝炎病毒无抗原交叉性的新型鸭肝炎病毒GD株全基因组序列测定的结果进行了分析。结果表明,基因组全长7786nt,包括652nt的5’UTR,6756nt的ORF,365nt的3’UTR和12nt的poly(A)尾。ORF编码一个2251aa的聚合蛋白,经3Cpro切割作用分为3个结构蛋白VP0/VP3/VP1和8个非结构蛋白2Al/2A2/2B,2C/3A/3B/3C/3D。GD株基因组核苷酸序列与DHV-1、台湾地区新型DHV、韩国新型DHV和我国广西分离的DHVG株的同源性分别为72.7-73.2%、78.2-78.3%、96.4-96.7%和99.2%。VP1蛋白氨基酸序列的同源性分别为76.9%、80.1-80.5%、92.9-93.3%和98.7%。依据小RNA病毒科肠道病毒属血清型分型标准,GD株与韩国新型DHV和DHVG株属于同一血清型,而与DHV-1和台湾地区新型DHV属于不同的血清型。
鸭肝炎病毒 GD株 基因组序列 血清型分型
袁率珍 李虹 姜畔 张兵 范小舟 范书才
中国兽医药品监察所,北京 100081 四川大学华西公共卫生学院,成都 610041
国内会议
南宁
中文
1175-1183
2009-09-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)