猪细小病毒主要非结构蛋白与结构蛋白的密码子偏爱性分析
通过分析猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)主要非结构蛋白(non-structural protein,NSI)及结构蛋白(VP1、VP2)的密码子偏爱性,为三种蛋白基因表达中宿主系统的选择提供参考。运用EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite)的CHIPS(Codon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP(Create a codonusage table)程序对PPV的NS1、VP1和VP2蛋白基因进行分析,并将分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,PPVNS1、VP1、VP2基因的Nc(Effectivenumbcr of codons)值分别为39.696、36.638、36.482,表明三种蛋白存在较明显的密码子偏爱性,并且均偏爱选择第三位核苷酸为A的密码子。PPV三种蛋白与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有一定差异,其中与酵母的密码子偏爱性差异最小,其表达系统选择在酵母较为合适。
猪细小病毒 非结构蛋白 密码子偏爱性 宿主系统选择
赵武 李斌 梁家幸 梁保忠 姚瑞英 黄安国 何颖 蒋玉雯
广西兽医研究所病毒研究室,广西南宁 530001
国内会议
南宁
中文
720-723
2009-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）