蛋白质质谱数据预处理和打分算法的研究
随着质谱技术的快速发展,目前我们已经能够在短时间内得到海量的质谱数据。而如何对如此大规模的数据进行处理,是目前蛋白质组学的难点之一。串联质谱数据对于蛋白质鉴定具有非常重要的意义,通过搜索已知蛋白质数据库,对蛋白质模拟酶解,再对肽模拟碰撞,得到理论串联质谱。本文提出了一种基于相对熵原理的打分算法,并采用了半小数规则、局部色谱保留时间、母离子电荷、缺失碎片离子补充等策略对理论数据和实验数据进行了预处理。
半小数规则 多肽局部色谱保留时间 母离子电荷 缺失碎片离 打分算法 数据预处理 蛋白质数据库
舒晨 刘嘉蓉 李通化
同济大学化学系,上海 200092
国内会议
上海
中文
32-33
2008-12-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)