正交设计优化假俭草SRAP-PCR反应体系及引物筛选
本研究以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶四种因素三个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系。结果表明,假俭草SRAP-PCR最佳反应体系为:2μl 10×PCR buffer、60ng模板DNA、Mg2+.50mmol1·L-1、dNTP260μmol-L-1、引物O.25μmol·L-1、TaqDNA聚合酶0.5U,总体积为20~tl。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg2+浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小。运用该体系对4份假俭草种源进行验证,证明该体系稳定可靠,并从45个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰,多态性丰富的26个引物组合。这一体系的建立及多态性弓”物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行假俭草分子遗传学研究提供了科学的依据。
假俭草 SRAP标记 体系优化 引物筛选 正交试验 分子遗传学
郑轶琦 王志勇 郭海林 薛丹丹 刘建秀
南京农业大学园艺学院 中国 南京 210095;江苏省中科院植物所(南京中山植物园) 中国 南京 210014 江苏省中科院植物所(南京中山植物园) 中国 南京 210014
国内会议
四川雅安
中文
252-260
2007-10-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)