BmK ANEPII同源模建及活性位点预测
东亚钳蝎(Buthus martensii Karsch,BmK)抗神经兴奋活性肽(anti-neuroexcitation peptide II precursor,ANEPII)是作用于钠离子通道的一种重要长链蝎毒。本文通过同源模建的方法运用Modeller9v1软件构建BmK ANEPII三维结构模型,运用Sybyl6.91软件包对初始模型进行分子力学和动力学优化,用Procheck对模建结构进行合理性验证,最终获得最优的同源模建三维结构。与同源性较高的蝎长链镇痛活性肽进行一级结构及空间结构比对,初步预测活性位点及活性区。位点主要包括:4对二硫键、保守的芳香族氨基酸及SiteC区。为进一步研究BmK ANEPII结与镇痛活性之间的关系提供理论支持。
东亚钳蝎 抗神经兴奋活性肽 同源模建 镇痛作用 活性位点
马琳 王健 杨文腰 张景海 宋永波
沈阳药科大学生命科学与生物制药学院, 辽宁沈阳110016
国内会议
石家庄
中文
1-7
2008-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)