Ⅰ型鸭肝炎病毒R株全基因组分析与检测技术的研究
本研究时一株DHV1毒株R进行了全基因组测定(EF585200)，序列经DNAstar分析发现，该毒株与其他GenBank发表的DHV1毒株基因组核苷酸序列同源性为94.2％～99.2％，编码聚合蛋白氨基酸序列同源性为98％～98.8％。表明DHV1-R株与其他毒株之间病毒基因组一级结构有较高的同源性。 通过分析表明DHV1-R株基因组结构为5”UTR-VPO-VP3-、VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3”UTR。在遗传进化关系上与副肠孤病毒属(Parechovirus)亲缘关系较近。参照鸭肝炎病毒Ⅰ型基因序列设计特异性引物，分别进行巢式PCR和SYBR Green Ⅰ实时荧光定量RT-PCR方法检测鸭肝炎病毒Ⅰ型，结果表明巢式PCR敏感性为6pg/mL。实时荧光定量RT-PCR确定特异性产物的Tm值，同时做普通RT-PCR。试验结果表明，特异性产物的Tm值为85.6℃，最低能检测到含0.015fg/μL止阳性质粒标准品。以阳性质粒标准品10倍系列稀释的模板进行实时荧光定量PCR，通过对反应体系和反应条件进行筛选和优化，建立了检测鸭肝炎病毒Ⅰ型的标准曲线。建立的巢式PCR与SYBR Green Ⅰ实时荧光定量RT-PCR检测方法显示了较好的特异性、敏感性，为鸭肝炎病毒Ⅰ型的临床检测和流行情况调查提供了新的技术手段。
Ⅰ型鸭肝炎病毒 全基因组 巢式PCR 荧光定量PCR
罗玉均 张桂红 陈建红 廖明 徐小芹 任涛 张济培 罗开健
华南农业大学兽医学院 广东广州 510642 佛山科学技术学院生命科学学院 广东南海 528231
国内会议
北京
中文
42-49
2007-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）