柔性受体模型方法的并行程序设计及应用

摘要：

本文柔性受体模型(FLARM)方法是一种新的基于虚拟受体模型的药物设计方法。在FLARM 1.0中已经实现了受体模型的柔性运动,但是由于计算量的限制，配体分子仍然刚性不运动。在FLARM 2.0中，使用MPI并行方式实现了配体的柔性运动特性，FLARM 2.0中使用了改进的遗传算法，将受体模型群体平均分配到不同节点，由不同节点分别处理各自受体模型中的配体分子柔性优化过程,从而实现了较高性能的并行效果。

关键词： 药物设计 虚拟受体 计算机仿真 并行计算

作者: 裴剑锋 沈斌 周家驹 来鲁华

作者单位: 北京大学化学与分子工程学院,分子动态与稳态结构国家重点实验室,北京大学理论生物学中心 北京 100871 中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心,北京 100080 中国科学院过程工程研究所,北京 100080

会议类型: 国内会议

会议名称: 第8届全国并行计算大会

会议地点: 辽宁大连

会议语种:中文

页码: 177-180

在线出版日期: 2004-07-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）