单颗粒重构软件EMAN 的并行设计与实现

摘要：

EMAN是当今使用最广泛的单颗粒重构软件之一，然而其处理过程及其耗时。针对这一问题，本文详细阐述了EMAN单颗粒重构中最耗时的模型优化部分所采用的算法，结合算法不同部分的特点，设计了相应的优化与并行加速策略。在曙光4000高性能计算机上的试验结果表明，经过优化和并行化的程序能够获得较高的性能和较好的加速比。

关键词： 高性能计算 并行计算机 单颗粒重构 调度程序

作者: 樊莉亚 张法 王功明 刘志勇

作者单位: 中国科学院计算技术研究所 北京;中国科学院研究生院 北京 [e-mail];[e-mail];[e-mail];[e-mail] 中国科学院计算技术研究所 北京 中国科学院计算技术研究所 北京;中国科学院研究生院 北京 [e-mail];[e-mail];[e-mail];[e-mail]

会议类型: 国内会议

会议名称: 2008年全国高性能计算机学术年会

会议地点: 无锡

会议语种:中文

页码: 486

在线出版日期: 2008-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）