新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达验证及生物信息学分析
目的：验证新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达，初步探讨NYGGF4的生物信息学特征。 方法：采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证肥胖与正常儿童脂肪组织中NYGGF4基因的表达差异，应用DNAStar、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、SOSUI、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析NYGGF4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等。 结果：NYGGF4基因是一个未知的新基因，差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中，该基因cDNA全长1527bp，开放阅读框长753bp，编码250个氨基酸，预测相对分子质量28271，定位在胞浆，蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构，为一非分泌、可溶的亲水性蛋白，蛋白结构域分析提示NYGGF4的N端有一较短的亲脂性靶向序列、C端有-PTB(phosphotyrosine-bindingdomain)结构域。 结论：NYGGF4基因是一差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中的新基因，可能是胞浆内一个信号转导分子，可能在肥胖的发生发展过程中发挥重要功能，有进一步研究的价值。
NYGGF4基因 肥胖患儿 脂肪组织 表达验证 生物信息学 信号转导分子
高春林 邱洁 郭锡熔 王玢 倪毓辉 张敏 李晓南 吴伟玲 陈荣华
南京医科大学附属南京妇幼保健院儿科 210004 南京医科大学儿科医学研究所
国内会议
济南
中文
133-137
2008-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）