果梅Tyl-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析
本文是以果梅甲州小梅(Prunus mume‘Jiazhou Xiaomei”)的春梢叶片为试材，以Tyl-COpia类逆转座子逆转录酶保守片段对应的兼并引物进行PCR扩增、克隆。研究了果梅中Tyl-COpia类逆转座子逆转录酶序列的特点。研究发现，由于存在着缺失和终止密码子突变，果梅基因组内Tyl-COpia类逆转座子存在着很大异质性，例如：PM19在3′端发生了明显的缺失，并有11条序列发生了1-4个终止密码子：并且由于物种间的差异，果梅基因组中的逆转座子与其他物种问存在着较大的差异。在对克隆到的果梅逆转录酶序列，进行了聚类分析，可以将着37条序列分成3个家族；其中第一个家族包含了16条序列，并与芥菜(Brassica juncea)有着很高的相似性；第二家族和第三家族分别包含8条和13条序列。将克隆到的37条序列(DQ494215-DQ494251)与已在Genbank上登陆的不同物种的同类型逆转座子的逆转录酶进行了聚类分析，发现果梅中Tyl-COpia类逆转座子与芥菜、苹果、缘毛杨、挪威云杉、玉米和水稻中同种类型的逆转座子可能有相同的起源。这对进一步研究果梅基因组内逆转座子的特性有重要的意义。
果梅 Tyl-copia类逆转座子 逆转录酶 异质性 聚类分析 基因克隆
王飞 孙俊 房经责 章镇
南京农业大学园艺学院，江苏南京210095 安徽农业大学园艺学院，安徽合肥230031
国内会议
成都
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317-317
2008-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）