原子力显微镜观察错误组装的端粒T-loop结构
人类端粒DNA是由5-15 kb的串联的重复序列(TTAGGG)n维成,3”末端为单链悬突(3”-overhanging)并回折形成环形(T-loop)结构,保护3”单链悬突,防止染色体末端降解、重组和融合.最近发现DNA损伤后端粒结合蛋白TRF2位于双链断裂处,可能参于DNA修复.到目前为止,还没有证据表明TRF2蛋白参于损伤的端粒T-loop重建.本工作中,我们制备了四种(3”-单链悬突、平端、O6MeG-和8-HOG-)含(TTAGGG)06的线性端粒DNA模型.运用原子力显微镜(AFM)技术在纳米尺度上直接观察TRF2蛋白与上述模型端粒DNA的相互作用.结果表明TRF2蛋白能与3”-单链悬突端粒DNA结合并形成三种不同类型T-loop结构.Ⅰ型结构类似于细胞内端粒T-loop结构,其环-尾结合处DNA为三链结构,夹角通常大于90度.而Ⅱ型和Ⅲ型的两个线性双链以纽结方式形成T-loop,其环-尾结合处DRA多为四链结构,夹角通常小于90度.首次观察到TRF2蛋白也能够使损伤的线性平端-、O6MeG-和8-HOG-端粒DNA形成不同类型T-loop结构.此过程不依赖于3”单链悬突的存在,也不要求额外的能源.我们的发现提出了一种可能性,在细胞内TRF2蛋白可通过一种错配方式使损伤DNA重新折叠形成一种不稳定无功能的T-loop.提示细胞内异常T-loop的形成可能是端粒DNA损伤后TRF2蛋白错误修复的结果.这种新的作用不同与先前提出的TRF2蛋白对端粒的保护作用.
原子力显微镜 DNA损伤 TRF2蛋白 T-loop结构 端粒保护
郭晓飞 李辉 曹恩华
中国科学院生物物理研究所,北京 100101
国内会议
郑州
中文
398-403
2008-09-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）