鸭疫里默氏杆菌Ⅰ型磷酸二酯酶基因的发现及其分子特征分析

摘要：

以兔抗鸭疫里默氏杆菌(RA)阳性血清对RA血清1型CH-1株表达型DNA文库中已通过蓝白斑筛选的一个阳性克隆进行原位杂交筛选。经过5次免疫筛选后,阳性斑经过体内删除、噬菌粒经酶切分析和序列测定,得到一段4434bp的插入DNA片段。运用NCBI的BLASTN、BLASTP、ORF Finder、Conserved Domains、EMBL的FASTA等程序对其中一个命名为ORF1689的开放阅读框架进行了全面的生物信息学分析。结果显示ORF1689起始密码子上游存在核糖体结合位点,完整ORF含1689bp,编码562 aa,其编码蛋白的理论分子量为59.5kD,等电点为5.82。ORF1689具有phosphodiest蛋白家族的保守区域,与丙杆菌属的Caulobacter sp.K31、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)、Sphingopyxis alaskensis和Novosphingobium aromaticivorans的Ⅰ型磷酸二酯酶基因的氨基酸序列同源性分别为49.283％、38.716％,38.693％和38.313％,表明该基因是一种新的Ⅰ型磷酸二酯酶基因。该研究结果对阐明Ⅰ型磷酸二酯酶的生物学功能和RA的生理特性与致病机理提供了理论基础和实验数据。

关键词： 鸭疫里默氏杆菌 磷酸二酯酶 分子特征 编码蛋白

作者: 陈虹 程安春 汪铭书 朱德康

作者单位: 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,四川雅安,625014 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,四川雅安,625014 动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安,625014 四川农业大学动物微生态工程研究中心,四川雅安 625014 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,四川雅安,625014 动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安,625014

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第四届第九次全国学术研讨会暨饲料和动物源食品安全战略论坛

会议地点: 河南新乡

会议语种:中文

页码: 89-93

在线出版日期: 2008-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）