人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究

摘要：

从UCSC数据库提取基因序列,通过codon W软件进行密码子偏好性分析。比较分析不同外显子谱的人类蛋白编码基因密码子使用偏好,发现在多外显子基因中,随着基因外显子数增加,NNu和NNA型密码子RSCU值上升,NNC型密码子RSCU值下降,UUG密码子RSCU值增加,而其它NNG型密码子RSCU值下降。作为具有最少外显子数的基因,单外显子基因密码子RSCU值具有异常的表现,表明其具有和多外显子基因不同的起源和进化过程。

关键词： 人类蛋白编码基因 外显子谱 同义密码子 偏好特征 进化过程

作者: 杨潇 胡军 陈祥贵

作者单位: 西华大学生物工程学院,四川,成都,610039

会议类型: 国内会议

会议名称: 第六届全国搜索引擎和网上信息挖掘学术研讨会

会议地点: 南昌

会议语种:中文

页码: 79-82

在线出版日期: 2008-04-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）