应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌
目的：以gyrB基因序列为基础，采用系统发育分析方法构建进化树，对种系间关系密切的病原菌进行区分鉴别。 方法：测序获得本地区19株大肠埃希氏菌、13株志贺菌，2株豚鼠气单胞菌、2株嗜水气单胞菌、1株维隆气单胞菌的gyrB基因序列，并将其同公共数据库已有序列合并，构建进化树。分析各序列在树中的聚类关系，以此对菌株进行种水平分类鉴别，并同BLAST查询结果相比较。 结果：对检测的所有序列，除鲍氏和痢疾志贺菌外，在进化树上与之最邻近的5条序列均为该种菌株。而BLAST查询对一部分菌株返回了非该物种或分类不定的序列。 结论：以系统发育方法对种系发生关系密切的病原菌序列进行鉴别，具有较好的分辨力和准确度。
病原菌鉴别 系统发育树 gyrB基因
曹清毅 侯晓丽 陈智
浙江大学附属第一医院传染病研究所,310003
国内会议
浙江舟山
中文
2007-05-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）