新生隐球菌变种间ITS序列差异的研究
目的:利用真菌核糖体基因内转录间隔区(ITS)序列分析和系统进化学分析来研究新生隐球菌上海变种的地位及变种间ITS序列的差异。 方法:采用真菌通用引物ITS1、ITS4,对12株新生隐球菌不同变种标准株的ITS片断进行PCR扩增和测序,结合GenBank等数据库中11株新生隐球菌标准株的ITS序列,用CLUSTAL w1.83软件多重比对分析序列的差别,MEGA3.1软件处理数据绘制系统进化树。 结果:新生隐球菌变种之间ITS序列存在明显差异,存在6种亚型;gattii变种ITS序列存在4种亚型;我国发现的新生隐球菌上海变种S8012与gattii变种在表型及分子生物学研究均存在显著的差异,但仍属于变种内差异,归入gattii变种的ITS C型;gattii变种RV20186归入gattii变种的ITS F型;新生隐球菌尿素酶阴性株D<”2>Y系─grubii变种突变菌株。 结论:我国发现的上海变种S8012归入gattii变种的ITS C型;原gattii变种RV20186归入gattii变种的ITS F型。
新生隐球菌 核糖体基因 突变菌株 ITS序列分析 分子分型
陈敏 廖万清 吴绍熙 姚志荣 陈江汉 徐红 陈裕充
第二军医大学长征医院皮肤科
国内会议
杭州
中文
81-86
2007-03-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)