一株猪口蹄疫亚洲1型病毒VP1基因的克隆及其二级结构和B细胞抗原表位预测
本研究对一株猪口蹄疫亚洲1型分离株的主要抗原基因VP1进行了扩增和测序,并与国内外报道序列进行同源性比对,结果与国内报道株同源性在83.3％-86.4％之间,而与国外报道株的同源性在24.8％-98.4％。进化树分析发现其为国内报道株的一个新的分支,因此其来源可能为变异株或外来毒株.采用Garnier-Robso法、Chou-Fasman法、Karplus-Schultz法对VP1进行二级结构分析,采用Kyte-Doolittle法分析氨基酸序列亲水性、Emini法预测特定区域位于蛋白质表面的可能性、Jameson-Wolf法预测各结构蛋白的抗原指数,最后获得VP1结构蛋白的B细胞抗原表位。通过对二级结构的分析和与国内报道序列的比较,发现该株病毒VP1基因具有较高的抗原表位区域。
猪 口蹄疫 亚洲1型病毒 结构蛋白 二级结构 B细胞抗 VP1基因 基因克隆
罗昊 王红宁 黄勇 杨鑫 陈景锐 段少军 刘立
四川农业大学动物科技学院,雅安,四川,625014 四川大学”985工程”西南资源环境与灾害防治科技创新平台,四川大学生命科学学院,四川大学动物疾病防控生物工程研究中心,成都,610064
国内会议
江西井冈山
中文
168-172
2007-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）