斜带石斑鱼两种几丁质酶cDNA的克隆及序列分析
本文首次从斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)胃cDNA文库中克隆到两种几丁质酶epch1论文和epch2基因.根据克隆的cDNA序列,推测epch1蛋白有477个氨基酸,分子量约52.4kD;epch2蛋白有494个氨基酸,分子量约为53.6kD.氨基酸序列分析显示这两种酶都含有glyco-18区域、几丁质结合区域、酶催化活性位点等典型的几丁质酶结构区域特征,epch1和epch2之间的同源性(77%)要低于epch1和比目鱼酸性几丁质酶1(同源性为83%)以及epch2和比目鱼酸性几丁质酶2(同源性为84%)之间的同源性.Epch1和人类、鼠类、斑马鱼酸性几丁质酶的同源性在60%-65%之间.此外,epch2具有脊椎动物酸性几丁质酶的特征性序列,一段丝氨酸和甘氨酸的S-G重复序列,因此可以推测epch2属于酸性几丁质酶;而在epch1中没有发现S-G重复序列,也没有脊椎动物胰腺特异性几丁质酶的特征性的苏氨酸重复序列,但基于epch1与比目鱼酸性几丁质酶1的高度同源性,并含有一段特征性的NVP序列,推测epch1可能是酸性几丁质酶中的一个新种类.
斜带石斑鱼 几丁质酶 克隆 序列分析
纪群 冯少珍 李文笙 林浩然
有害生物控制与资源利用国家重点实验室,广东省水生经济动物良种繁育重点实验室,中山大学生命科学学院,广州,510275
国内会议
2006全国海洋生物技术与海洋药物学术会议暨全国第九届海洋药物学术研讨会
大连
中文
356-360
2006-08-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)