基因组移位重组过程快速计算
基因组重组有三个基本操作:移位,翻转和转位。本文讨论有向基因组移位排序的快速计算方法:(1)给出有向基因组移位排序算法的实现方法。其中设计了断点图、灰边、圈、MSP 的存储结构,给出断点图初始化、准 MSP 判定、有效移位选择算法的详细实现步骤,并在移位选择算法的实现中采用了随机方法。(2)修正了原有算法中的错误。原有算法均未曾考虑到可行移位产生偶隔离带的情况,本文给出了这种情况的实例,设计新算法修正了这一错误,并通过实验验证了新算法的正确性和计算效率。
基因组 移位 快速计算
尹晓 朱大铭
山东大学计算机科学技术学院,济南250061
国内会议
武汉
中文
2005-10-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)