基于基因型和表型关系的基因数据库—知识库混合系统的设计
(0) 后基因组时代，从基因型到表型的生物学机理研究，对于理解生命活动、肿瘤的诊断和治疗、药物开发等起着关键作用。对来自基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表型组学等层次的海量生物分子数据的有机整合和知识发现，是对生物信息学研究的一个挑战。本文提出了在从基因型到表型的框架中构建基因数据库——知识库混合系统的设想，目的是为了针对特定的生物学研究任务，收集、整理研究所需要的生物分子数据和现有的知识，该混合系统能够帮助研究人员快速获取数据和知识，并对数据分析得到的信息进行生物学知识的评价，产生新的生物学知识。在提出该混合系统的基本设计原则后，以 NFKB混合系统为例介绍了系统的实现，NFKB 系统集成了人类基因组、基因表达数据、蛋白质-DNA 相互作用等数据和知识。最后，以 NF-kappaB 靶基因的识别为例说明了 NFKB 系统的应用。
生物信息学 知识库-数据库混合系统 生物数据
谢建明 刘宇辉 孙啸 陆祖宏
东南大学生物电子学国家重点室，南京210096
国内会议
武汉
中文
2005-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）