一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案

摘要：

基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出了一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.这种方案对所要进行比对分析的大规模序列库按照某种策略进行分割部署,使机群中每个结点处理整个序列库的一部分,有效减少了磁盘I/O和结点间通讯开销,适合低价高效的Linux机群系统.

关键词： 并行优化 EST序列库 分割部署

作者: 牛北方 郎显宇 陆忠华 迟学斌

作者单位: 中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心,北京,100080

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国科学院计算技术研究所第八届计算机科学与技术研究生学术讨论会

会议地点: 大连

会议语种:中文

页码: 147

在线出版日期: 2004-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）