猪CTSD基因3”UTR区SNP检测及PCR-RFLP分析
选取生产性能具有明显差异的4个猪品种(大花白、二花脸、杜洛克和长白)构建品种DNA池,采用测序的方法研究猪CTSD基因3”非翻译区(426bp)序列的多态性,快速筛查到2个SNP位点(A-1664G和C-1930A).进一步对A-1664G位点利用MlsI内切酶进行PCR-RFLP和利用测序图中SNP等位基因峰高的比值估算各猪品种等位基因的频率,结果表明猪CTSD基因3”UTR区M1sI位点中3种基因型在4个品种中分布在中外猪种中卡方检验差异显著(P＜0.05):(1)AA基因型频率在外国猪种(杜洛克和长白)中明显高于中国猪种(大花白和二花脸);(2)A等位基因频率在外国猪种中分布接近1.0,而在中国猪种中接近0.5,显示该位点可能是一个用于分析中外猪种性能差异的分子标记;(3)在4个品种中,大花白、二花脸、杜洛克和长白猪中不同基因型的分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)(4)卡方检验用2种方法得到的频数X2值,差异均不显著(P＜0.05),说明测序峰高比值估算的等位基因频率与RFLP得到的基因频率基本相符.
猪CTSD基因 SNP检测 PCR-RFLP分析 基因检测
梅盈洁 李加琪
华南农业大学动物科学学院,广州,510642
国内会议
北京
中文
271-275
2006-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）