8.HIV-1病毒的核酸异质性及准种特点的研究
目的 研究Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)膜蛋白基因(env)的准种与变异特点.方法 采用巢式PCR方法对5例艾滋病患者血浆HIV-1env基因C2～V3区进行PCR扩增,产物经纯化后克隆至PMD-18T载体中,每例患者分别挑取5～8个克隆,共34株,完成阳性克隆的鉴定、抽提纯化和测序,将获得的DNA序列及氨基酸序列进行分析,并计算其氨基酸同源替换率(ds)与非同源替换率(dn)的比值.结果 同一患者体内HIV准种株平均为83.5％,各克隆株之间的核苷酸同源性在88％～99％之间;不同患者之间的核苷酸同源性在75％～91％;34株序列的V3区平均变异频率明显高于C2～C3区(P＜0.05);而V3区和C2～C3区的ds/dn比值均＞1.结论 艾滋病患者体内有大量HIV准种存在,基因的变异在V3区发生较频繁,免疫选择压力在该区变异中不起主要作用.
人类免疫缺陷病毒 HIV准种 基因变异
黄慧谦 王辉 陆坚 徐六妹 李丽雄 王火生 周伯平
深圳市东湖医院,广东深圳,518020
国内会议
深圳
中文
95-99
2006-02-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）