精确量子化学方法确定CoMFA中的模板分子
20S蛋白酶体是一种多功能催化酶的复合物.它参与生物体内许多重要的生理过程,并与许多重要疾病有关.近年来,随着20S蛋白酶体结构的确定,对蛋白酶体抑制剂的研究受到了高度重视. 肽醛类化合物是最早被发现的蛋白酶体抑制剂.由于其低廉的价格及快速逆转的特性,目前在20S蛋白酶体的功能研究中仍然被作为首选药物. 3D-QSAR在药物设计中显示出了日益重要的地位.特别是其中的CoMFA(比较分子力场分析)具有非常准确的分析预测能力,使用这种方法设计成功的药物越来越多.但进行CoMFA分析最重要的一步就是模板分子构象的确定,而许多药物分子的药效相是未知的.本文比较了肽醛类抑制剂的模板分子MG101的晶体结构和在GAUSSIAN98软件包中的B3LYP/6-311G(d,p)精度水平下计算的低能构象,再运用SYBYL6.9工作站进行分子叠合,得到两个构象的RMSD为0.667,说明在没有分子晶体结构数据的情况下,运用高精度量子化学计算得到的分子的低能构象也可以作为CoMFA的模板分子.
精确量子化学 20S蛋白酶体 抑制剂 模板分子
朱永强 葛泽梅 崔景荣 李润涛
北京大学药学院,北京,100083
国内会议
郑州
中文
182
2005-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）