多序列比对CLUSTAL W中两序列比对的并行

摘要：

多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着积极的意义.以clustalw为代表的渐进式多序列比对算法在这个领域取得了很大的成功,成为应用最为广泛的多序列比对程序.但是当比对数目比较多的时候,时间仍然比较长,本文设计一种的clustalw并行算法,给出计算实例,并分析了比对效率和加速比.

关键词： 生物信息学 多序列比对 clustalw

作者: 尹智刚 王希诚 谷俊锋

作者单位: 大连理工大学软件学院,大连,116023 大连理工大学工业结构分析国家重点实验室,大连,116023

会议类型: 国内会议

会议名称: 第16届全国计算机新科技与教育研讨会

会议地点: 乌鲁木齐

会议语种:中文

页码: 66-72

在线出版日期: 2005-07-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）