条斑紫菜超氧化物歧化酶全长基因序列分析
依据本实验室已有的条斑紫菜(Porphyrayezoensis)cDNA文库的EST分析结果,选择与紫菜抗逆性相关的超氧化物歧化酶(Superoxidedismutase,SOD)基因.对该克隆的插入片断进行测序,得一段1019bp的核苷酸序列.将其与GenBank中的序列进行比对,发现其与Mn-SOD的基因具有较高的相似性.后用DNAsis等生物软件对其进行序列分析,表明其包含一个完整的ORF,编码224个氨基酸和终止密码子,其中包含四个与Mn2+的结合位点及一个保守的金属结合结构域,预测分子量为24394.38Da;该基因的ORF中在第三位密码子处,(G+C)的使用率高达84.9﹪,说明该基因中存在着密码子使用的偏向性问题.该序列推导的氨基酸与莱茵衣藻(Chlamydomonasreindardtii)、斜生栅藻(RhodopirellulabalticaSH1)等物种的Mn-SOD相比,相似性分别为59﹪、54﹪;与嗜热脂肪芽胞杆菌(Geobacillusstearothermophilus)、Oceanobacillusiheyensis、绿丝菌(Chloroflexusaurantiacus)等物种的Mn-SOD相似性分别为:58﹪、57﹪、55﹪.后对六种海藻的Mn-SOD的氨基酸序列进行比对,表明该序列为条斑紫菜Mn-SOD基因的全序列.这是第一次在紫菜中有关该基因的报道.
条斑紫菜 超氧化物歧化酶基因 核苷酸序列 序列分析
茅云翔 王荣 周晓君 庄筠昀
中国海洋大学海洋生命学院,266003,青岛,中国
国内会议
厦门
中文
662-667
2005-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）