不同编码方法对蛋白质二级结构预测精度的影响

摘要：

蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测关键步骤.考虑氨基酸编码方式对预测精度的影响,提出基于一种改进的BP算法,采用3种不同氨基酸序列编码方式进行蛋白质二级结构的预测.在不同编码方式下,运用MATLAB语言实现改进BP神经网络的初始化和训练,并分析比较了各编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响.实验表明,采用此BP算法时,氨基酸序列的正交编码方式可获得较高的预测精度.

关键词： 蛋白质二级结构 编码方式 改进BP网络 预测精度

作者: 马栋萍 阮晓钢

作者单位: 北京工业大学电子信息与控制工程学院,北京,100022;北京联合大学生物化学工程学院,北京,100023 北京工业大学电子信息与控制工程学院,北京,100022

会议类型: 国内会议

会议名称: 2005年中国模糊逻辑与计算智能联合学术会议

会议地点: 深圳

会议语种:中文

页码: 234-237

在线出版日期: 2005-04-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）