SARS冠状病毒M蛋白的生物信息学研究
针对GenBank上发布的来自不同国家地区的39条SARS CoV推测M蛋白,采用生物信息学软件分析其核酸和氨基酸序列,获得其分子生物学特征,确定突变位点,预测功能结构区、Motif及抗原决定簇,比较基因突变对这些功能结构的影响.结果表明:在39个病毒株M蛋白的666bp中,共有18个病毒株在7个位点上发生了25次变异.在M蛋白序列上预测获得3个跨膜螺旋序列和一个可能的信号肽序列.氨基酸序列的变异主要发生在其跨膜和胞外区域,胞内区域相对较少.预测发现12个Motif和7个抗原决定簇.提示突变对M蛋白的结构功能区的影响不大,也未造成M蛋白的Motif的数量和构成发生改变.对抗原决定簇的影响也主要体现在序列成分构成的改变上,在设计疫苗时,应考虑由其导致的抗原特性改变.
非典型性肺炎 冠状病毒 膜蛋白 生物信息学 抗原特性
刘树春 赵雨杰 张学
中国医科大学医学基因组学研究室(辽宁沈阳) 中国医科大学基础医学院生物芯片中心(辽宁沈阳)
国内会议
重庆
中文
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2004-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）